Die HD-C18-Phase eignet sich am besten zur Trennung hochhydrophober, kleiner Moleküle mit geringen strukturellen Unterschieden – zum Beispiel Isomere. Die Dichte der C18-Ketten auf der Oberfläche der organosilica-hybriden Partikel ist höher als bei Scepter C18. Dadurch erfahren Moleküle, die aufgrund ihrer Größe zwischen die C18-Ketten passen, mehr Wechselwirkungen als Moleküle, deren Struktur dies nicht zulässt oder nur teilweise. Dies ermöglicht eine leichtere Trennung von Molekülen mit kleinen strukturellen Unterschieden.